Геномная платформа

Команда

Отдёл генетики GENES DIFFUSION (GD) состоит из семи сотрудников ЖД (инженер, генетик, био-информатик, био-статистик, исследователь, руководитель проекта, лаборант), а также аспирантов. Эта команда имеет вес в научной среде, где государственные и частные организации работают вместе.

Институт Пастера в Лилле является частной некоммерческой организацией, контролируемой государством. Основной сферой его деятельности являются биомедицинские исследования. Сегодня университетский городок этой организации насчитывает более 1000 человек, посвящающих каждый свой день исследованиям, экспертной работе и получению специальных знаний, направленных на улучшение здоровья человека и окружающей среды.

Сертификация Illumina

certification-illuminaВ апреле 2010 г. американское общество, Illumina, специализирующееся на производстве микрочипов для ДНК, официально позволяет сертификацию CS Pro генетической лаборатории Gènes Diffusion.

Эта сертификация подтверждает компетентность организации в проведении генетического анализа. Сертификация гарантирует высокую точность расшифровки и обработки данных, полученных в результате применения геномного тестирования. Таким образом,  Gènes Diffusion становится первой европейской лабораторией генетики животных.

В то же время, геномная платформа Gènes Diffusion  была официально утверждена Valogène (Общество по распространению геномного индекса в Европе) как партнерская лаборатория  по генотипированию. Лаборатория GD одна из всего лишь двух французских лабораторий способных и уполномоченных на выполнение генотипирования скота молочных пород Голштинской, Монбельярдской и Нормандской. Данные генетической лаборатории Gènes Diffusion используются для получения официальных данных по скотоводству, рассчитываемых в  INRA(Французский национальный институт сельскохозяйственных исследований).

Ноу-хау

Gènes Diffusion предлагает всем, кто участвует в совершенствовании скота (селекционеры, селекционные компании, кооперативы) услуги, использующие передовые биотехнологии.

  • Выделение и очистка ДНК из биологических образцов, для применения в области молекулярной биологии (секвенирование, генотипирование, диагностические исследования)
  • Генотипирование средней и высокой плотности для изучения генетических вариаций, маркеров и передачи признаков, а так же их связь с фенотипом.
  • Биобанк  для хранения биологических образцов и данных
  • биологический и микробиологический анализ
  • ПЦР и КПЦР, технику для проведения молекулярной диагностики
  • Сбор и анализ данных (описательная статистика)
  • Проектирование и эксплуатация биостатистической моделей
  • Оценка данных (расчет или моделирование индекса, геномный отбор)

Геномика

Генетика раскрывает свои тайны

Плод 10 лет исследований на национальном уровне – геномный индекс может дать более точную генетическую информацию о продуктивности  животного сразу после рождения.

Основные понятия геномики представлены ниже

От индивидуалчных к ДНК

Каждое живое существо (человек, корова, кукуруза …) состоит из клеток. Каждая клетка содержит ядро, содержащее хромосомы. Хромосома состоит из длинной молекулы ДНК.

ДНК

ДНК  представляет собой молекулу, которая является основным компонентом хромосом. Содержит генетическую информацию в форме генов, которые определяют синтез белков.

ДНК источник различий

Различие между индивидами объясняются различиями в их генах, которые определяются с использование биотехнологических методик с применением генетических маркеров. Маркер есть индикатор, позволяющий узнать больше о формировании отдельных признаков.

ДНК-чип

ДНК-чип представляет собой очень мощный биотехнологический инструмент. Он позволяет идентифицировать тысячи маркеров СНП. У крупного рогатого скота, наиболее известным является чип Иллюмина 54к , который идентифицирует  54 000 СНП.